Embora as raízes do Congregacionalismo nos levem de volta ao Novo Testamento, o Congregacionalismo na América é geralmente ligado aos Puritanos e aos Separatistas  na Inglaterra do Séc. XVI. Os Puritanos eram membros da Igreja da Inglaterra estabelecida, que desejavam ver a Igreja purificada interiormente. Muitas das tradições e das práticas, que se desenvolveram na Inglaterra, eram sem nenhum fundamento bíblico. Os Puritanos almejavam uma Igreja mais pura, que fosse baseada somente na Bíblia.
 Alguns Puritanos chegaram a conclusão de que a Igreja da Inglaterra jamais poderia ser purificada interiormente, então eles se separaram da Igreja, e por isso foram chamados de Separatistas. Eles formaram congregações independentes e freqüentemente tinham de se reunir secretamente por causa da grande perseguição que sobreveio contra eles. Muitos foram aprisionados e alguns foram até martirizados pela sua fé.
 Uma destas congregações independentes estava situada na cidade de Seroody. Foi formada em 1606, reuniam-se secretamente , num lugar de reunião para o “povo livre” do Senhor.
 Quando suas reuniões tornaram-se conhecidas, eles começaram a experimentar uma grande perseguição. Afim de escapar desta perseguição, eles decidiram fugir para a Holanda, secretamente, onde havia liberdade religiosa. Em 1608, depois de muitas dificuldades, 125 de seus membros chegaram à Holanda e estabeleceram na cidade Leidan.
 No princípio, eles tinham uma vida confortável na Holanda. Sob a liderança de seu pastor, Rev. John Robison, desenvolveram relações amigáveis com os Puritanos que decidiram permanecer na Igreja da Inglaterra. Eles fundaram uma Imprensa e publicavam apenas livros Puritanos e Separatistas. Contudo, sua Imprensa levou outra vez a perseguição e um Oficial da Igreja, William Brewster, foi aprisionado por um tempo. Quando a pressão aumentou, eles decidiram navegar através do Oceano para o que foi chamado de Novo Mundo. Embarcaram no navio “Mayflower” e chegaram em Massachussets em novembro de 1620. Quarenta e dois dos 102 tripulantes eram membros da Igreja Separatista em Leidan. Três deles eram da congregação originária de Seroody. Viram-se como Peregrinos, e ,desde  então, foi desta forma que eles foram lembrados. Seu primeiro inverno na Nova Inglaterra foi muito difícil. A metade deles morreram. Mas daquele pequeno começo, a colônia Plymouth cresceu.
 Pouco tempo depois dos Peregrinos chegarem no Novo Mundo, a situação na Inglaterra piorou. Charles I assumiu o trono e o novo Arcebispo era William Laud. A perseguição contra os Puritanos na Inglaterra aumentou e, por volta de 1640 , aproximadamente , 20 mil Puritanos haviam partido para a América, por causa da liberdade religiosa. Na Inglaterra, eles eram uma parte da Igreja da Inglaterra, mas no Novo Mundo eles estabeleceram congregações em ordem. Eles eram apaixonados pela Palavra de Deus e queriam ser fundamentados na Bíblia em sua fé e em sua prática. Eles convenceram-se de que o Congregacionalismo é a forma bíblica de governo eclesiástico. Havia diversas passagens das Escrituras que os influenciavam.
 Em Atos, por exemplo, havia 120 dos seguidores de Jesus, reunidos num quarto mais alto em Jerusalém. Eles estavam adorando ao Senhor e esperando a descida do Espírito Santo, como Jesus havia prometido. Mas no meio de sua adoração eles tiveram uma Assembléia. Eles selecionaram um sucessor para o lugar de Judas Iscariotes, que havia traído o Senhor. Eles oraram: “Senhor, mostra-nos a quem Tu escolheste”. Em outras palavras, eles não estavam buscando suas próprias vontades, nem mesmo estavam buscando a vontade dos apóstolos, estavam buscando a vontade do Senhor. Os apóstolos não estavam ditando os resultados, mas toda a congregação estava esperando em Deus e Ele fez conhecida a Sua vontade.
 Naquela atmosfera, o Espírito Santo desceu. Todos, não só os apóstolos , mas todos eles foram cheios do Espírito Santo. Na pregação de Pedro, foi citado o texto de Joel 2.28,29... “Derramarei o Meu Espírito sobre toda a carne; vossos filhos e vossas filhas profetizarão, vossos velhos sonharão e vossos jovens terão visões; até sobre servos e sobre as servas derramarei o Meu Espírito naqueles dias”. Foi para ninguém ser excluído .  Não existe nenhum alusão a uma hierarquia espiritual. Todos da Igreja foram equipados para estarem envolvidos no ministério.
 Em Atos 6, houve uma outra Assembléia. Os gregos achavam que suas viúvas estavam sendo esquecidas na distribuição de comida. Então, os apóstolos reuniram toda a Igreja, e a congregação escolheu sete homens para encarregarem desta responsabilidade. Esta foi uma decisão congregacional. Todos estavam satisfeitos com o resultado e a reunião encerra-se com uma oração. Não só o problema foi assistido, mas a Palavra de Deus foi propagada e o número de discípulos foi aumentado.
 Em Atos 13, lemos a respeito do envio dos primeiros missionários . A Igreja em Antioquia estava reunida em oração. No meio de sua adoração o Espírito Santo disse: “... Separai-me a Barnabé e a Saulo para a obra que Eu os tenho chamado”. Então a Igreja jejuou e orou e depois impuseram suas mãos sobre eles e a congregação os enviou. E esta  viagem foi encerrada, Barnabé e Saulo retornaram à Igreja e relataram à toda a congregação o que O Senhor havia feito. A congregação os enviara e  recebia notícias deles.
 Em Atos 15, lemos sobre o 1 Concílio envolvendo mais de uma congregação. A Igreja em Antioquia e a Igreja em Jerusalém reuniram-se para discutir se os gentios deveriam ser ou não circuncidados e obedecerem a lei de Moisés, afim de se tornarem cristãos. Em outras palavras, nós somos salvos pela graça através da fé ou somos salvos por obras ? Foi a Igreja em Antioquia que convocou o Concílio. Eles não podiam decidir este assunto por eles mesmos, então eles pediram ajuda. Houve muita discussão. Pedro compartilhou suas experiências. Paulo e Barnabé compartilharam as suas. Tiago baseou-as nas Escrituras. Uma decisão foi tomada e uma carta escrita para a Igreja em Antioquia.  Toda a congregação participou e escreveu em suas palavras: “Pareceu  bem ao Espírito Santo e a nós...” E a  própria congregação escolheu àqueles que levariam a carta à Antioquia. Foi uma decisão congregacional baseada em discussão completa na Palavra de Deus e na oração. Não foi um caso de uma Igreja ter autoridade sobre uma outra, mas foi o caso de uma Igreja suplicar a ajuda à uma outra Igreja.
 Estas são algumas das Escrituras que os Puritanos e os Separatistas consideraram, e eles chegaram a uma conclusão de que Jesus é O Senhor da Igreja Universal e O Senhor de cada Igreja Local.
 O Congregacionalismo na América cresceu em sua influência. Isto conduziu ao caminho da educação . A Universidade de Harvard e de Yale foi estabelecida para treinar os pastores Congregacionais. Deartnouth foi estabelecida para treinar missionários Congregacionais, afim de que pudessem evangelizar os índios. Mais de 50 faculdades e universidades foram fundadas pelos Congregacionais porque eles acreditavam que deviam ter uma liderança eclesiástica instruída e um povo instruído. Onde quer que os Congregacionais fossem pelo país eles abriam escolas dedicadas à fé e a prática congregacional.
 Os Congregacionais também estavam na dianteira de implantação de Igrejas. Quando os Congregacionais espalharam-se por New England, sua primeira incumbência foi estabelecer uma Igreja em cada povoado novo. Em 1798, a primeira sociedade missionária nacional foi organizada na América. Seu objetivo era “cristianizar os indígenas da América do Norte, manter e promover o conhecimento cristão nos  novos povoados dentro dos Estados Unidos”. Em 1826, a Sociedade Missionária Nacional Americana foi reformada, a qual tornou-se depois a Sociedade Missionária Nacional Congregacional. Grupos de estudantes seminaristas foram enviados para o oeste para implantar novas Igrejas. Para os primeiros Congregacionais, era inconcebível ter um povoado sem uma única Igreja.
 Os Congregacionais estavam também na dianteira da atividade missionária. Nossos imigrantes ingleses Puritanos, na vinda ao Novo Mundo não estavam somente interessados na liberdade religiosa, mas também na divulgação do Evangelho. O Rev. John Robison, o pastor peregrino na Holanda, expressou o desejo de que eles podiam fixar um bom fundamento, pelo menos, fazer um bom começo para divulgação e o avanço do Evangelho do Reino de Cristo nas mais remotas partes do Novo Mundo. O primeiro selo da Companhia de Massachussets tinha a figura de um índio” com as palavras: “Atravessem e ajudem-nos!”  Logo no ano de 1640, havia missionário pregando missionário para os índios. A primeira Bíblia publicada no Novo Mundo foi de uma tradução indígena. David Brained foi um dos primeiros missionários para os indígenas.
 O começo do movimento missionário moderno está também ligado aos Congregacionais e ao histórico Encontro de Oração de Haystack. Uma noite, um grupo de estudantes avistou um abrigo debaixo de um monte de feno durante uma tempestade. E naquele lugar estranho, eles oravam e o Senhor avivou o zelo missionário dentro de seus corações. Daquela reunião de oração surgiu a Junta Americana de Comissários para Missões Estrangeiras. Esta foi a primeira Sociedade Missionária nos Estados Unidos e em apenas alguns anos, ela tinha enviado missionários a todas as partes do mundo.  A ênfase principal era de pregar o Evangelho, traduzindo as Escrituras e fundando escolas cristãs.
 Na América, nós temos uma grande herança congregacional. Mas você também tem uma grande herança aqui no Brasil. Também no Brasil, os Congregacionais estavam historicamente na dianteira da educação , na frente da implantação e na frente de missões. Sigamos as pegadas daqueles que iniciaram antes. Não desistamos ! Trabalhemos mais ainda! Gastemos mais tempo! Estejamos envolvidos completamente na Obra do Senhor até que Jesus venha outra vez. Da mesma forma que tivemos um grande passado, podemos ter um futuro grande para a glória de Deus.